במחקר, שבחן את תשלומי הרשות לאסירים, בדק המרכז את הרקע האידיאולוגי והפוליטי לתשלומים אלה: “תשלומים אלה מבטאים תמיכה גלויה ובוטה בטרור, העומדת בסתירה להתחייבות שהפלסטינים נטלו על עצמם בהסכמי אוסלו”.חוקר המרכז הירושלמי יוני בן מנחם דיווח: “מערכת ההסתה הפלסטינית מציגה את המחבל הדוקר יוסף ג’בארין מהכפר יטא כראשון שנענה לקריאה לסייע למסגד אל־אקצא. בימים האחרונים יש קמפיין ברשתות החברתיות שמסית ואומר כי מסגד אל־אקצא בסכנה וכי ישראל רוצה לחלק את המסגד בין יהודים למוסלמים, כפי שעשתה במערת המכפלה בחברון”.